Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl53Q9D1H8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl53Q9D1H8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms