Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TbcbQ9D1E6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TbcbQ9D1E6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TbcbQ9D1E6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms