Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpsap1Q9D0M1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpsap1Q9D0M1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms