Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndc80Q9D0F1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndc80Q9D0F1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndc80Q9D0F1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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