Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ribc1Q9D0B8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ribc1Q9D0B8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ribc1Q9D0B8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms