Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf146Q9CZW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf146Q9CZW6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf146Q9CZW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms