Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd2Q9CZB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd2Q9CZB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thumpd2Q9CZB3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd2Q9CZB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.6 ms