Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm17509Q9CZ61 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm17509Q9CZ61 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm17509Q9CZ61 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm17509Q9CZ61 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,13
Gm17509Q9CZ61 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm17509Q9CZ61 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,77■□□□□ 0,11
Gm17509Q9CZ61 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Gm17509Q9CZ61 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm17509Q9CZ61 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm17509Q9CZ61 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm17509Q9CZ61 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm17509Q9CZ61 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,6 ms