Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem39aQ9CYC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmem39aQ9CYC3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms