Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sgo1Q9CXH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sgo1Q9CXH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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