Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ist1Q9CX00 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ist1Q9CX00 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ist1Q9CX00 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ist1Q9CX00 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ist1Q9CX00 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ist1Q9CX00 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ist1Q9CX00 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms