Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smc3Q9CW03 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Smc3Q9CW03 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smc3Q9CW03 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms