Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Sycp2Q9CUU3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Sycp2Q9CUU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Sycp2Q9CUU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Sycp2Q9CUU3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
Sycp2Q9CUU3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Sycp2Q9CUU3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Sycp2Q9CUU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms