Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otud1Q9CUB6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otud1Q9CUB6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms