Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rprd1bQ9CSU0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rprd1bQ9CSU0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms