Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snw1Q9CSN1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snw1Q9CSN1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snw1Q9CSN1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snw1Q9CSN1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms