Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ska2Q9CR46 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ska2Q9CR46 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ska2Q9CR46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ska2Q9CR46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms