Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931417E11RikQ9CR05 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931417E11RikQ9CR05 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms