Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Asf1aQ9CQE6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asf1aQ9CQE6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1aQ9CQE6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms