Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl39lQ9CQD0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpl39lQ9CQD0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl39lQ9CQD0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpl39lQ9CQD0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpl39lQ9CQD0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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