Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3bpQ9CQ82 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb3bpQ9CQ82 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3bpQ9CQ82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms