Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921530L21RikQ9CQ47 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921530L21RikQ9CQ47 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms