Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NenfQ9CQ45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NenfQ9CQ45 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NenfQ9CQ45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NenfQ9CQ45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NenfQ9CQ45 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NenfQ9CQ45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NenfQ9CQ45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NenfQ9CQ45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NenfQ9CQ45 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NenfQ9CQ45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms