Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg3Q9CPX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg3Q9CPX6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg3Q9CPX6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atg3Q9CPX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms