Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsmce3Q9CPR8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsmce3Q9CPR8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsmce3Q9CPR8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms