Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl17Q9CPR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl17Q9CPR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl17Q9CPR4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl17Q9CPR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpl17Q9CPR4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1566.5 ms