Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6cQ99N08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6cQ99N08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms