Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CalcbQ99MP3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CalcbQ99MP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CalcbQ99MP3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms