Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KarsQ99MN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KarsQ99MN1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KarsQ99MN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms