Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atp1b4Q99ME6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Atp1b4Q99ME6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atp1b4Q99ME6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atp1b4Q99ME6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms