Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms