Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcc1Q99LI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clcc1Q99LI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Clcc1Q99LI2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcc1Q99LI2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms