Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
EtfaQ99LC5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EtfaQ99LC5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EtfaQ99LC5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EtfaQ99LC5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EtfaQ99LC5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms