Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rab28Q99KL7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Rab28Q99KL7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab28Q99KL7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab28Q99KL7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab28Q99KL7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab28Q99KL7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Rab28Q99KL7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Rab28Q99KL7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21,45■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,2 ms