Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlgn1Q99K10 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nlgn1Q99K10 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlgn1Q99K10 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nlgn1Q99K10 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms