Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk9Q99J95 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk9Q99J95 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk9Q99J95 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk9Q99J95 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk9Q99J95 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms