Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg5Q99J83 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg5Q99J83 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg5Q99J83 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms