Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Ddb2Q99J79 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Ddb2Q99J79 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ddb2Q99J79 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Ddb2Q99J79 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Ddb2Q99J79 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddb2Q99J79 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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