Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GhdcQ99J23 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GhdcQ99J23 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GhdcQ99J23 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GhdcQ99J23 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms