Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc6Q924W5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc6Q924W5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smc6Q924W5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc6Q924W5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 634.4 ms