Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sf3b3Q921M3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sf3b3Q921M3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sf3b3Q921M3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sf3b3Q921M3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sf3b3Q921M3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.3 ms