Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp4Q921I6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp4Q921I6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp4Q921I6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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