Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FdpsQ920E5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FdpsQ920E5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FdpsQ920E5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms