Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med28Q920D3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms