Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab4bQ91ZR1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab4bQ91ZR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab4bQ91ZR1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms