Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Trpm2Q91YD4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Trpm2Q91YD4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33,18■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Trpm2Q91YD4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33,07■■■□□ 2,89
Trpm2Q91YD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Trpm2Q91YD4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Trpm2Q91YD4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Trpm2Q91YD4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,1 ms