Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lnx2Q91XL2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lnx2Q91XL2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lnx2Q91XL2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lnx2Q91XL2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lnx2Q91XL2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lnx2Q91XL2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms