Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfpqQ8VIJ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SfpqQ8VIJ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SfpqQ8VIJ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SfpqQ8VIJ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms