Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cabp4Q8VHC5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cabp4Q8VHC5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cabp4Q8VHC5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cabp4Q8VHC5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms