Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx18Q8VDS8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx18Q8VDS8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx18Q8VDS8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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